El FONTAR posee distintos instrumentos de financiación que se implementan a través de la modalidad de Convocatorias Públicas o Ventanilla Permanente.

Convocatorias Públicas (CP)
En las bases de las convocatoria se establece una fecha límite para presentación de proyectos ante el Fontar.

Ventanilla Permanente (VP)
Los proyectos a financiar no tiene establecida una fecha límite, por lo tanto es posible su presentación ante el Fontar